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The available engine options for the Protege are:
- M.T. DOHC
- M.T. SOHC 4WD
- M.T. SOHC 2WD
- 2.0L AT (VIN 5 or 6)
- 2.0L MT exc. MP3 (VIN 5 or 6)
- 2.0L MT MP3 (VIN 7 or 8)
- 1.6L (VIN 2 or 4) from VIN 549027
- 1.6L (VIN 2 or 4) thru VIN 549026
- VIN JM1BG DOHC (VIN 6)
- VIN JM1BG SOHC (VIN 3 or 4)
- VIN JM1BA 1.8L (VIN 2 or 4) AT
- VIN JM1BA 1.8L (VIN 2 or 4) MT
- VIN JM1BA 1.5L (VIN 1 or 3)
- DOHC (VIN 6)
- SOHC (VIN 3, 4 or 8)
- 1.8L (VIN 2 or 4) AT
- 1.8L (VIN 2 or 4) MT
- 1.5L (VIN 1 or 3)
- 1.8L (VIN 2 or 4) AT from 1/97
- 1.8L (VIN 2 or 4) AT thru 12/96
- 1.8L (VIN 2 or 4) MT from VIN 131461
- 1.8L (VIN 2 or 4) MT thru VIN 131460
- 1.5L (VIN 1 or 3) from VIN 194743 (10/97)
- 1.5L (VIN 1 or 3) thru VIN 194742 (9/97)
- 1.8L (VIN 1)
- 1.6L (VIN 2) low emis
- 1.6L (VIN 2) std emis (Fed) AT
- 1.6L (VIN 2) std emis (Fed) MT
- 1.8L (VIN 1 or 3)
- 1.6L (VIN 2 or 4) low emis
- 1.6L (VIN 2 or 4) std emis (Fed) AT
- 1.6L (VIN 2 or 4) std emis (Fed) MT
- 2.0L (VIN 5 or 6) AT
- 2.0L (VIN 5 or 6) MT
- 1.6L (VIN 2 or 4)
- 2.0L exc. MAZDASPEED (VIN 5 or 6) AT
- 2.0L exc. MAZDASPEED (VIN 5 or 6) MT
- 2.0L MAZDASPEED (VIN 7 or 8)
- A.T. DOHC
- A.T. SOHC 4WD
- A.T. SOHC 2WD
- M.T. SOHC
- A.T. SOHC
- M.T. 1.8L VIN JM1BG DOHC
- M.T. 1.8L VIN JM1BG SOHC
- M.T. 1.8L VIN JM1BA
- M.T. 1.5L
- A.T. 1.8L VIN JM1BG DOHC
- A.T. 1.8L VIN JM1BG SOHC
- A.T. 1.8L VIN JM1BA from VIN 114727
- A.T. 1.8L VIN JM1BA thru VIN 114726
- A.T. 1.5L
- M.T. 1.8L from 12/95
- M.T. 1.8L thru 11/95
- A.T. 1.8L
- M.T. 1.8L
- M.T. 1.6L
- A.T. 1.6L
- A.T. 2.0L
- M.T. 2.0L
- A.T. 2.0L Htbk (Protege5) from 3/02
- A.T. 2.0L Htbk (Protege5) thru 2/02
- A.T. 2.0L Sdn ES from 3/02
- A.T. 2.0L Sdn ES thru 2/02
- A.T. 2.0L Sdn LX
- A.T. 2.0L Sdn DX
- M.T. 2.0L exc. MAZDASPEED
- M.T. 2.0L MAZDASPEED
- A.T. 2.0L Htbk (Protege5)
- A.T. 2.0L Sdn ES

